ControllerX

Single-cell Sequenzierungen mit ControllerX therapiebegleitend bei Anti-Tumor-Vakzinen

01.09.2025 bis 30.09.2028

Das Projekt zielt darauf ab, einen 10x Chromium Controller X als essenzielles Laborgerät für die Kinderklinik zu beschaffen. Dieses Gerät ermöglicht die effiziente Einzel-Zell-Extraktion und Probenaufbereitung für hochauflösende Einzel-Zell-RNA-Sequenzierungen (scRNA-seq) beispielsweise im Rahmen der PerVision Studie zur Entwicklung patientenspezifischer Tumortherapien. Schwerpunkt ist das Immunmonitoring von Patientinnen und Patienten mit fusionsgengetriebenen Sarkomen und die Identifikation tumorspezifischer sowie patientenspezifischer T-Zell-Rezeptor-Sequenzen.
Ein eigener 10x Chromium Controller X gewährleistet eine zeitnahe und flexible Probenverarbeitung, was für die Qualität der scRNA-seq-Daten unabdingbar ist. Im Gegensatz zur Nutzung der universitären Core Facility ermöglicht das Gerät eine unabhängige und schnellere Durchführung direkt in der Kinderklinik, ohne Verzögerungen durch Transport oder eingeschränkte Zugänglichkeit. Dies ist entscheidend, da frische Immunzellenproben nur bei schneller Verarbeitung hochwertige funktionale sowie T-Zell-Rezeptor-Analysen erlauben.
Der Aufbau eines eigenständigen Arbeitsbereichs mit dem 10x Chromium Controller X ist somit fundamental, um innovative, maßgeschneiderte Immuntherapien in der Kinderklinik Tübingen effektiv zu erforschen und zu realisieren.