Shotgun-Proteomik

Nano-Festphase für den Enzymverdau

01.01.2026 bis 31.12.2028

Die Shotgun Proteomik ist eine leistungsstarke Hochdurchsatztechnik zur Identifizierung und Quantifizierung von Proteinen in komplexen biologischen Proben wie Patientenseren oder Gewebeextrakten. Sie wird in den nächsten Jahren in den klinischen Alltag einziehen, da Mediziner deren Einsatz für die Krankheitsklassifikation, Therapieüberwachung, prädiktive Diagnostik sowie personalisierte Medizin wünschen.
Heutige LC-Tools für die Shotgun-Analytik sind jedoch nicht auf hohen Durchsatz ausgelegt. Die Probenvorbereitung hat zu viele separate Arbeitsschritte und aufgrund langer Nanosäulen dauern Trennungen sehr lange (60-120 Minuten). So sind die personellen und instrumentellen Kapazitäten der Kliniklabore schnell ausgelastet.
Die Projektpartner werden daher einen neuen, durchgängigen Workflow für die Probenvorbereitung und LC-Trennung und die hierfür notwendigen Tools entwickeln. Hierzu gehören neue Non-Touch-Vorsäulen, Festphasen-Nano-Verdausäulen und kurze Nano-LC-Säulen mit hoher Trenneffizienz.
Der Arbeitsaufwand und die Analysezeit auf dem LC-MS/MS-Instrument werden dadurch auf ein Drittel reduziert.